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― 수확 잔사 및 발효 축분 등을 논에 깐다 (양은 많을수록 좋다)
― EM 퇴비 : 300평에 30kg 정도
― EM 활성액 : 100배 정도 희석하여 300평에 150L 정도 살포한다.
― 벼를 벤 후 기온이 비교적 높을 때 가급적 빨리 처리하고 논에 물을 대어 
   두면 좋다.
― 겨울 동안 둔다.
※ 물대기가 어려운 경우는 경운을 한다.

― 모내기 한달 전에 100평당 EM 발효제 30～50㎏과 EM 100배 희석액  200ℓ을 살포하고 얇게 논을 간다.
― 가을에 발효제를 넣었던 경우에는 넣지 않아도 좋다. 

― 소금물로 우량 종자 선택
― 온수 침적 : 60℃에서 5초
― 종자를 발아시킬 때 EM활성액(1000배 희석)에 매일 담근며, 희석액은 매일 교환한다. 

― 모판 작업시 1,000배 희석액을 살포한다.
― 부직포 제거 후 모내기까지 2～3일 간격으로 EM활성액(500배 희석)을 살포한다. 

― 이식 직전 : EM활성액(500배 희석)을 모에 살포한다 
― 모의 간격은 줄간 40cm 모간 25cm를 유지한다. 
※ 밀식하지 말도록 주의할 것 

― EM발효제 : 이삭 패기 2주전에 100평당 10kg을 시비한다. 
― EM활성액 : 병해충예방 및 생육을 위하여 한달에 1번 정도 200～500배 희석액을 엽면살포한다.
    (이삭패기 10일전에는 꼭 살포) 
※ 논에 물을 넣을 때 EM활성액을 300평 당 10리터씩 논 물꼬에서 소량씩 주입한다. (월 1회 이상 연 4～6회 정도 주입한다) 

― EM-당밀제초법 : 모내기 5일 이내에 300평당 EM활성액과 당밀 20리터를 10배 정도 희석하여 투입한다.
    (참조 : EM과 당밀에 의한 친환경 논 잡초방제 )
― 왕우렁이 제초법 : 모내기 5일 이내에 300평당 왕우렁이를 15～20kg을 투입한다. 

― EM농법 첫해에는 이삭거름으로 화학비료를 예년의 10분의 1 정도 사용하는 것이 좋으나 과다사용하면 도복하기 쉬워진다.
― 병충해 : 모내기 시에 밀식을 하지 않았으면 어느 정도의 병충해는 무시해도 좋다. (심하다 싶으면 EM5 살포)
― 병충해 발생예방으로 EM5 발효액을 200～500배로 희석하여 엽면 살포한다.
― 침수지역의 벼는 물이 빠진 즉시 EM 활성액과 광합성세균을 200～500배로 희석하여 엽면 살포한다.
― 일조량부족, 저온피해가 우려되는 해에는 EM 활성액을 자주 살포한다. 

1. 사용방법 (300평 기준)
 ① 로터리를 고르게 잘 한다.
② 모 이식 후 가급적이면 물을 깊이 댄다.
③ 이식 후 3～5일 이내에 EM활성액과 당밀을 각각 20L씩 200L 정도의 물에 고루 녹인 후 골고루 살포한다. 10배 희석되어 있으므로 벼에 직접 닿아도 전혀 해가 없다.
④ 살포 후 2일간은 물을 넣거나 빼지 않도록 한다. 
⑤ EM-당밀을 투입 후 1개월간은 수심관리(7cm 이상)를 잘해야 한다. 
⑥ 왕우렁이를 같이 투입하여 제초를 할 경우 높은 제초효과를 볼 수 있다. 

2. 사용후 변화 
① 토양표면이 갈색으로 되며 EM-당밀에 의한 유기산 생성으로 잡초의 발아 및 발근을 저해한다.
② 살포 후 1～2주 이내에 물벼룩, 올챙이, 새우투구 등이 무수히 번식하여 논의 물 빛깔이 뿌였게 변하고 개구리밥 등이 다량으로 생겨나 물속 발아 잡초들의 광합성을 억제한다.
③ 농약 사용시 사라졌던 지렁이와 미꾸라지 등의 생물이 나타난다.

3. EM-당밀제초법이 곤란한 조건
① 물이 잘 빠지는 사질토양은 물을 깊이 댈 수 없어 효과가 감소된다.
② 계단식 논 : EM-당밀제초 후 물관리가 어렵다.
③ 수온이 15℃이하의 경우 잡초가 발아하지 않아 제초효과가 반감된다.